Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL23P55773 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL23P55773 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL23P55773 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL23P55773 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL23P55773 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL23P55773 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL23P55773 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL23P55773 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL23P55773 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL23P55773 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL23P55773 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL23P55773 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL23P55773 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL23P55773 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL23P55773 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL23P55773 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL23P55773 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL23P55773 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL23P55773 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL23P55773 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCL23P55773 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL23P55773 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL23P55773 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL23P55773 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms