Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MFAP3P55082 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFAP3P55082 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms