Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP1P54107 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms