Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV2P52735 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV2P52735 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV2P52735 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV2P52735 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV2P52735 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV2P52735 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV2P52735 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV2P52735 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAV2P52735 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV2P52735 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV2P52735 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV2P52735 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV2P52735 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV2P52735 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV2P52735 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms