Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms