Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE6CP51160 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE6CP51160 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6CP51160 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms