Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP153P49790 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP153P49790 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP153P49790 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP153P49790 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUP153P49790 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUP153P49790 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP153P49790 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP153P49790 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP153P49790 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP153P49790 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP153P49790 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP153P49790 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP153P49790 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NUP153P49790 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NUP153P49790 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NUP153P49790 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP153P49790 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP153P49790 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP153P49790 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP153P49790 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP153P49790 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUP153P49790 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUP153P49790 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUP153P49790 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUP153P49790 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUP153P49790 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUP153P49790 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUP153P49790 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUP153P49790 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP153P49790 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP153P49790 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP153P49790 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP153P49790 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP153P49790 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUP153P49790 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NUP153P49790 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NUP153P49790 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP153P49790 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP153P49790 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP153P49790 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUP153P49790 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NUP153P49790 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms