Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLK1P49759 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLK1P49759 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLK1P49759 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLK1P49759 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLK1P49759 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLK1P49759 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLK1P49759 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLK1P49759 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLK1P49759 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLK1P49759 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLK1P49759 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLK1P49759 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLK1P49759 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLK1P49759 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms