Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC11A1P49279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC11A1P49279 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms