Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME1P48163 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME1P48163 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME1P48163 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME1P48163 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ME1P48163 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ME1P48163 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME1P48163 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME1P48163 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME1P48163 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME1P48163 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME1P48163 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms