Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms