Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPA9P38646 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA9P38646 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA9P38646 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA9P38646 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms