Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	YNG1	YOR064C	660 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	QCR2	YPR191W	1107 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	BUD22	YMR014W	1560 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	NTH2	YBR001C	2343 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	FBP26	YJL155C	1359 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	ERG7	YHR072W	2196 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	UGA1	YGR019W	1416 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	CTF13	YMR094W	1437 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YFL012W-A	YFL012W-A	375 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	COX6	YHR051W	447 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	VPS25	YJR102C	609 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	ATG38	YLR211C	681 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YNL108C	YNL108C	813 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	snR10	snR10	245 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TRS33	YOR115C	807 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	CCL1	YPR025C	1182 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	MUD1	YBR119W	897 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	SPO1	YNL012W	1896 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	PST1	YDR055W	1335 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	KTR6	YPL053C	1341 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	GCR2	YNL199C	1605 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	MGA1	YGR249W	1371 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TMN2	YDR107C	2019 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	ACS2	YLR153C	2052 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	PCL8	YPL219W	1479 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	MET3	YJR010W	1536 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RIM15	YFL033C	5313 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YDL109C	YDL109C	1944 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	ERT1	YBR239C	1590 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	NRG1	YDR043C	696 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	SPT15	YER148W	723 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YFR045W	YFR045W	930 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TYS1	YGR185C	1185 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YGR226C	YGR226C	210 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	CKA1	YIL035C	1119 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RRT1	YBL048W	312 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YNL320W	YNL320W	855 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	BUD17	YNR027W	954 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	snR11	snR11	258 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	DCI1	YOR180C	816 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TMA16	YOR252W	537 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TYE7	YOR344C	876 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	UBX7	YBR273C	1311 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	AAP1	YHR047C	2571 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	SWI3	YJL176C	2478 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YFL040W	YFL040W	1623 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	AAD4	YDL243C	990 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RSM10	YDR041W	612 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RPL28	YGL103W	450 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	PEX21	YGR239C	867 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	EFG1	YGR271C-A	702 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YIL028W	YIL028W	399 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	PRP21	YJL203W	843 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	MBR1	YKL093W	1020 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	REC102	YLR329W	795 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YLR462W	YLR462W	609 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TEM1	YML064C	738 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	MDM38	YOL027C	1722 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	CIK1	YMR198W	1785 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YDR396W	YDR396W	501 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YPT6	YLR262C	648 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RPP0	YLR340W	939 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YBL096C	YBL096C	309 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	RCL1	YOL010W	1104 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	NAT3	YPR131C	588 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	SPT14	YPL175W	1359 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	HOF1	YMR032W	2010 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	HTB1	YDR224C	396 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YEL010W	YEL010W	351 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	SDS22	YKL193C	1017 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	GCD7	YLR291C	1146 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	CPR3	YML078W	549 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	MRPL16	YBL038W	699 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	TRI1	YMR233W	681 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	SPS18	YNL204C	903 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YOR283W	YOR283W	693 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	GRE1	YPL223C	507 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	PMT5	YDL093W	2232 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	REF2	YDR195W	1602 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YNL011C	YNL011C	1335 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	CPR4	YCR069W	957 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	COB	Q0105	1158 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	PCL7	YIL050W	858 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YAR069C	YAR069C	294 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YBR053C	P38235	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		4.84	□□□□□ -1.63

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