Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP62P37198 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP62P37198 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP62P37198 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP62P37198 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP62P37198 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP62P37198 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP62P37198 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP62P37198 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP62P37198 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms