Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBRP36941 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTBRP36941 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTBRP36941 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTBRP36941 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBRP36941 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBRP36941 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBRP36941 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBRP36941 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBRP36941 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBRP36941 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBRP36941 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBRP36941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBRP36941 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms