Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms