Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms