Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	KIN4	YOR233W	2403 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	RGP1	YDR137W	1992 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	ATG2	YNL242W	4779 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	PHO13	YDL236W	939 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	RCR2	YDR003W	633 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	DSD1	YGL196W	1287 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	FUR1	YHR128W	651 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YAE1	YJR067C	426 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	SEC72	YLR292C	582 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YPL162C	YPL162C	822 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	NTH1	YDR001C	2256 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YPR003C	YPR003C	2265 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	GPI10	YGL142C	1851 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YCR023C	YCR023C	1836 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VMA11	P32842	YDR444W	YDR444W	2064 nt		3.28	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	THI13	YDL244W	1023 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	COX2	Q0250	756 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	IGO2	YHR132W-A	396 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	THI11	YJR156C	1023 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	snR37	snR37	386 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	PBN1	YCL052C	1251 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YOL075C	YOL075C	3885 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YNR065C	YNR065C	3351 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	RDH54	YBR073W	2877 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	AIP1	YMR092C	1848 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SNO1	YMR095C	675 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	INA17	YPL099C	549 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	PRE2	YPR103W	864 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	VMA1	YDL185W	3216 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SPO77	YLR341W	1434 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MIS1	YBR084W	2928 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	FAS2	YPL231W	5664 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	UBP6	YFR010W	1500 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	RIM4	YHL024W	2142 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YCF1	YDR135C	4548 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	ELO2	YCR034W	1044 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SPC19	YDR201W	498 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YFR045W	YFR045W	930 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	TIM21	YGR033C	720 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YJR112W-A	YJR112W-A	330 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MCM1	YMR043W	861 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YPL025C	YPL025C	558 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	COA2	YPL189C-A	207 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	HO	YDL227C	1761 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	UGA3	YDL170W	1587 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SSL1	YLR005W	1386 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	DHH1	YDL160C	1521 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	CLD1	YGR110W	1338 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	VPS73	YGL104C	1461 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	RCM1	YNL022C	1473 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MSW1	YDR268W	1140 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YGL199C	YGL199C	471 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	VMA22	YHR060W	546 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YHR173C	YHR173C	339 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	BAT2	YJR148W	1131 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	EFM2	YBR271W	1260 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	FAR10	YLR238W	1437 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MDL1	YLR188W	2088 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	LTV1	YKL143W	1392 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MMT1	YMR177W	1533 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	GAS2	YLR343W	1668 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	BUD8	YLR353W	1812 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	FAA1	YOR317W	2103 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	RKM4	YDR257C	1485 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	COP1	YDL145C	3606 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	PRP11	YDL043C	801 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MRS3	YJL133W	945 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	ELF1	YKL160W	438 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	PEX30	YLR324W	1572 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SWC7	YLR385C	399 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	FLD1	YLR404W	858 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	ABP140	YOR239W	1887 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	ARO80	YDR421W	2853 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SRS2	YJL092W	3525 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	FMP25	YLR077W	1752 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YDL094C	YDL094C	510 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SPO73	YER046W	432 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	SPI1	YER150W	447 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YGL132W	YGL132W	336 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YGL188C	YGL188C	174 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YGR139W	YGR139W	339 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	PSR1	YLL010C	1284 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	IBD2	YNL164C	1056 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YAR1	YPL239W	603 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YPR015C	YPR015C	744 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	MRPS9	YBR146W	837 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	CYM1	YDR430C	2970 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	FAR8	YMR029C	1572 nt		3.21	□□□□□ -1.89
VMA11	P32842	YCR050C	YCR050C	309 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	IES6	YEL044W	501 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YGL193C	YGL193C	312 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	RPL14A	YKL006W	417 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SYF1	YDR416W	2580 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MST1	YKL194C	1389 nt		3.21	□□□□□ -1.9

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