Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA11P31270 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms