Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSPOP30536 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSPOP30536 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPOP30536 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPOP30536 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPOP30536 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSPOP30536 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSPOP30536 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSPOP30536 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSPOP30536 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPOP30536 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms