Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD1BP29016 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD1BP29016 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD1BP29016 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD1BP29016 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CD1BP29016 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD1BP29016 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD1BP29016 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms