Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCAP28676 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCAP28676 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCAP28676 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCAP28676 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GCAP28676 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCAP28676 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCAP28676 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCAP28676 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCAP28676 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCAP28676 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCAP28676 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCAP28676 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCAP28676 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCAP28676 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCAP28676 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCAP28676 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCAP28676 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCAP28676 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms