Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms