Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms