Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFKBIAP25963 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms