Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX3P23760 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX3P23760 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX3P23760 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX3P23760 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX3P23760 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX3P23760 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX3P23760 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX3P23760 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX3P23760 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX3P23760 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAX3P23760 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX3P23760 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms