Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms