Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BGNP21810 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BGNP21810 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BGNP21810 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BGNP21810 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BGNP21810 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BGNP21810 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BGNP21810 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BGNP21810 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BGNP21810 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BGNP21810 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BGNP21810 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms