Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A1P20849 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A1P20849 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A1P20849 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A1P20849 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A1P20849 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A1P20849 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms