Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAG1P15918 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAG1P15918 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAG1P15918 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAG1P15918 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAG1P15918 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAG1P15918 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAG1P15918 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAG1P15918 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAG1P15918 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAG1P15918 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAG1P15918 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAG1P15918 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAG1P15918 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAG1P15918 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAG1P15918 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG1P15918 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RAG1P15918 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAG1P15918 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAG1P15918 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAG1P15918 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAG1P15918 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAG1P15918 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms