Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAFP15056 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAFP15056 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAFP15056 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAFP15056 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAFP15056 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAFP15056 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAFP15056 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAFP15056 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRAFP15056 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRAFP15056 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRAFP15056 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRAFP15056 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRAFP15056 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms