Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB2P14652 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms