Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDPSP14324 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDPSP14324 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDPSP14324 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDPSP14324 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDPSP14324 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDPSP14324 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDPSP14324 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDPSP14324 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FDPSP14324 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDPSP14324 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDPSP14324 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDPSP14324 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDPSP14324 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDPSP14324 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDPSP14324 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDPSP14324 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDPSP14324 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDPSP14324 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDPSP14324 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms