Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI3P10071 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI3P10071 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI3P10071 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLI3P10071 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLI3P10071 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GLI3P10071 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI3P10071 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI3P10071 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI3P10071 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLI3P10071 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI3P10071 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI3P10071 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI3P10071 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI3P10071 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI3P10071 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLI3P10071 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLI3P10071 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLI3P10071 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms