Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2BP0DMP2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2BP0DMP2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms