Protein–RNA interactions for Protein: P09493

TPM1, Tropomyosin alpha-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM1P09493 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM1P09493 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM1P09493 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM1P09493 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM1P09493 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM1P09493 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM1P09493 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM1P09493 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM1P09493 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM1P09493 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM1P09493 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM1P09493 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM1P09493 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM1P09493 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM1P09493 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM1P09493 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM1P09493 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM1P09493 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms