Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPRCP08575 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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PTPRCP08575 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
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PTPRCP08575 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PTPRCP08575 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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PTPRCP08575 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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PTPRCP08575 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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PTPRCP08575 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
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PTPRCP08575 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRCP08575 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCP08575 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
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