Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APODP05090 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APODP05090 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APODP05090 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APODP05090 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APODP05090 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APODP05090 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APODP05090 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APODP05090 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APODP05090 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APODP05090 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APODP05090 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APODP05090 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APODP05090 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APODP05090 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APODP05090 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms