Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTNP04004 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTNP04004 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTNP04004 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTNP04004 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTNP04004 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTNP04004 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTNP04004 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms