Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EGFRP00533 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EGFRP00533 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EGFRP00533 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EGFRP00533 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EGFRP00533 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EGFRP00533 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EGFRP00533 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EGFRP00533 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EGFRP00533 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EGFRP00533 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EGFRP00533 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EGFRP00533 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EGFRP00533 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EGFRP00533 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EGFRP00533 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EGFRP00533 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EGFRP00533 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EGFRP00533 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EGFRP00533 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EGFRP00533 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EGFRP00533 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EGFRP00533 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EGFRP00533 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EGFRP00533 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EGFRP00533 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EGFRP00533 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EGFRP00533 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EGFRP00533 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EGFRP00533 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EGFRP00533 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EGFRP00533 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EGFRP00533 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EGFRP00533 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EGFRP00533 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EGFRP00533 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms