Protein–RNA interactions for Protein: O95782

AP2A1, AP-2 complex subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2A1O95782 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP2A1O95782 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2A1O95782 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms