Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN9O95484 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN9O95484 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN9O95484 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN9O95484 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN9O95484 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN9O95484 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN9O95484 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN9O95484 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN9O95484 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN9O95484 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN9O95484 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN9O95484 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN9O95484 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN9O95484 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms