Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAPGEF3O95398 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RAPGEF3O95398 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms