Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB5O95377 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB5O95377 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB5O95377 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB5O95377 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB5O95377 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB5O95377 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB5O95377 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB5O95377 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB5O95377 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB5O95377 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB5O95377 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB5O95377 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB5O95377 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB5O95377 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB5O95377 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB5O95377 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB5O95377 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB5O95377 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB5O95377 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB5O95377 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB5O95377 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB5O95377 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB5O95377 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB5O95377 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB5O95377 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms