Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms