Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX10O60683 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX10O60683 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX10O60683 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX10O60683 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PEX10O60683 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX10O60683 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX10O60683 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX10O60683 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX10O60683 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX10O60683 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX10O60683 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX10O60683 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX10O60683 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX10O60683 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX10O60683 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX10O60683 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX10O60683 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX10O60683 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX10O60683 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX10O60683 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX10O60683 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX10O60683 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX10O60683 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX10O60683 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX10O60683 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms