Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMFO60524 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMFO60524 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMFO60524 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMFO60524 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMFO60524 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMFO60524 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMFO60524 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMFO60524 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMFO60524 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMFO60524 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMFO60524 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMFO60524 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMFO60524 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMFO60524 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMFO60524 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMFO60524 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMFO60524 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMFO60524 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms