Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
KIAA0556O60303 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
KIAA0556O60303 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms