Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATMINO43313 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATMINO43313 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATMINO43313 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMINO43313 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMINO43313 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMINO43313 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMINO43313 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMINO43313 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATMINO43313 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATMINO43313 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATMINO43313 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATMINO43313 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATMINO43313 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATMINO43313 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMINO43313 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms