Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms